Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms