Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms