Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms