Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms