Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms