Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms