Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms