Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms