Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms