Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SH3GL3Q99963 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3GL3Q99963 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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