Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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