Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms