Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSAMQ8N6F7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms