Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms