Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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TRAPPC6BQ86SZ2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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