Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms