Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms