Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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