Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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