Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PTPRRQ15256 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PTPRRQ15256 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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