Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEA1Q15075 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms