Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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SHROOM2Q13796 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
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