Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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