Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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PEX6Q13608 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PEX6Q13608 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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