Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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