Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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ITGB3BPQ13352 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGB3BPQ13352 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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