Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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