Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PRKAA1Q13131 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PRKAA1Q13131 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PRKAA1Q13131 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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