Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXF1Q12946 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXF1Q12946 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXF1Q12946 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXF1Q12946 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXF1Q12946 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXF1Q12946 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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