Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms