Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
STX4Q12846 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms