Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms