Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSRP1Q08945 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms