Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL9Q07325 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL9Q07325 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms