Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms