Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms