Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms