Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FAM3AP98173 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FAM3AP98173 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FAM3AP98173 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM3AP98173 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM3AP98173 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM3AP98173 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM3AP98173 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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