Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms