Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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RAD23AP54725 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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RAD23AP54725 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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RAD23AP54725 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RAD23AP54725 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RAD23AP54725 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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RAD23AP54725 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RAD23AP54725 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RAD23AP54725 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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