Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3M2P53677 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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