Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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