Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NSG1P42857 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSG1P42857 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSG1P42857 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSG1P42857 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSG1P42857 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSG1P42857 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSG1P42857 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSG1P42857 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NSG1P42857 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms