Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP2P42575 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP2P42575 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms