Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETFBP38117 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETFBP38117 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms