Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms