Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms