Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB6P18564 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms