Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2A2P16615 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms