Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSP16219 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSP16219 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSP16219 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSP16219 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSP16219 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSP16219 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms